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Software und Tools

rhizoTrak

rhizoTrak ist ein Softwaretool zur komfortablen, manuellen Annotation von Wurzelbildern. Es ist insbesondere darauf ausgelegt, Zeitserien dieser Bilder, wie sie beispielsweise mit Hilfe der Minirhizotrontechnik aufgenommen werden, effizient handhaben und benutzerfreundlich annotieren zu können.

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PaCeQuant

A Tool for High-Throughput Quantification of Pavement Cell Shape Characteristics

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CytoskeletonAnalyzer2D

Das Tool dient zur Quantifizierung von strukturellen Ähnlichkeiten und Unterschieden im Cytoskelett, d.h. in der Organisation von Aktin- oder Mikrotubulistrukturen, von Zellen.

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MiToBo Cell Counter

An ImageJ/Fiji plugin for semi-automatic labeling and counting of spot-like structures and small cells in images. The plugin is based on the popular ImageJ CellCounter plugin by Kurt De Vos and extends its functionality towards improved usability and integration of automatic segmentation algorithms.

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